Mycobacterium tuberculosis klinik suşlarındaki izoniazid ve rifampin direncinin moleküler karakterizasyonu

Abstract

M-tuberculosis'in rifampin (RIF) ve izoniazid (INH)’e dirençli olması tüberküloz kontrolü için ciddi bir tehdit oluşturmaktadır. İlaca dirençli tüberkülozun kontrolü, dirençli vakaların hızlı ve uygun tedavisine dayanır. Farklı kaynaklardan elde edilen INH ve RIF dirençli M.tuberculosis klinik suşlannm moleküler özellikleri, yaygm olarak kullanılabilecek hızlı moleküler tam metodlanmn geliştirilmesinde yararlı bilgiler sağlayabilir. Bu çalışmada; Malatya bölgesinde toplanan 29 ilaca dirençli klinik izolat arasından INH ve RIF direncine neden olan iki gen, otomatize DNA dizi analizi ve multipleks alele özgül PZR(MAS-PZR) kullanılarak incelendi. îzolatlann 19’u çoğul ilaçlara dirençli, ikisi yalmzca RIF dirençli ve sekizi yalmzca INH dirençli izolatlardı. RIF direnci karakterizasyonu için, RIF direnci göstergesi olarak bilinen 81 bç’lik bölgeyi de içeren RNA polimerazın P alt ünitesini kodlayan gen olan rpoB geninin 250 bç’lik merkezi bölgesinin dizi analizi yapıldı. MAS-PZR, kodon 516, 526 ve 531 ’i hedef alıyordu. INH direnci karakterizasyonu katalaz-peroksidaz enzimini kodlayan gen olan katG geninin 435 bç’lik bölgesinin dizi analizi yapıldı. Bu bölge INH direnci ile en sık ilişki gösteren kodon 315’i de içeriyordu ve MAS-PZR’de kodon 315’teki mutasyonlann tespiti için kullanıldı.