Öz:Bu çalışma, klinik örneklerin homojenizasyonu ve dekontaminasyonunda kullanılan N-asetil-L-sistein-NaOH (NALC-NaOH) aşamasının tüberküloz tanısında kullanılan polimeraz zincirleme reaksiyonu (PZR)'nun duyarlılığı üzerine olumsuz etkisinin olup olmadığını belirlemek amacıyla yapılmıştır. Tüberküloz ön tanısı almış hastalardan alınan 147 balgam, 72 idrar ve 52 steril vücut sıvısı olmak üzere toplam 271 klinik örnek ile Mycobacterium tuberculosis H37Rv standart susundan hazırlanan 106, 104, 102 ve 101 cfu/ml yoğunluktaki bakteri süspansiyonları NALC-NaOH ile işlenmeden önce ve işlendikten sonra DNA izolasyonu yapılmıştır. İzole edilen DNA örnekleriyle yapılan PZR denemelerinde NALC-NaOH ile işlenmemiş balgam örneklerinde PZR duyarlılığı %95, NALC-NaOH ile işlenenlerde ise %41 olarak bulunmuştur. İdrar örneklerinde bu oran sırasıyla %93 ve %31, steril vücut sıvılarında ise %89 ve %11 olarak belirlenmiştir. Standart bakteri yoğunlukları ile yapılan 14 ayrı denemede NALC-NaOH ile işleme almanın PZR duyarlılığını özellikle düşük bakteri yoğunluklarında ( 102 ve 101 cfu/ml) önemli derecede azalttığı gözlenmiştir.
Abstract:This study was performed to evalute the effect of N-acetyl-L-cystein-NaOH (NALC-NaOH) on the sensitivity of polymerase chain reaction (PCR) used for diagnosis of tuberculosis. A total of 271 clinical specimens (147 sputum, 72 urine and 52 sterile body fluid samples) obtained from the patients suspected for tuberculosis and dilutions (106, 104, 102 and 101 cfu/ml) prepared from Mycobacterium tuberculosis H37Rv standard strain were used for DNA isolation before and after treatment with NALC-NaOH. The sensitivities of PCR performed with the DNA samples extracted from sputum samples were 95% and 41% before and after treatment with NALC-NaOH respectively. These values were found to be 92% and 31% in urine samples, 89% and 11% in sterile body fluids respectively. Similar decline in PCR sensitivity was observed with the 14 experiments performed by standard dilutions of mycobacterial suspensions especially at lower bacterial concentrations ( 102 and 101 cfu/ml) after treatment with NALC-NaOH.
