Arşiv logosu
  • Türkçe
  • English
  • Giriş
    Yeni kullanıcı mısınız? Kayıt için tıklayın. Şifrenizi mi unuttunuz?
Arşiv logosu
  • Koleksiyonlar
  • Sistem İçeriği
  • Analiz
  • Talep/Soru
  • Türkçe
  • English
  • Giriş
    Yeni kullanıcı mısınız? Kayıt için tıklayın. Şifrenizi mi unuttunuz?
  1. Ana Sayfa
  2. Yazara Göre Listele

Yazar "Najafabadi, Hamed S." seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 1 / 1
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Computational Methods for Analysis of the DNA-Binding Preferences of Cys2His2 Zinc-Finger Proteins
    (Humana Press Inc, 2018) Dogan, Berat; Najafabadi, Hamed S.
    Cys(2)His(2) zinc-finger proteins (C2H2-ZFPs) constitute the largest class of human transcription factors (TFs) and also the least characterized one. Determining the DNA sequence preferences of C2H2-ZFPs is an important first step toward elucidating their roles in transcriptional regulation. Among the most promising approaches for obtaining the sequence preferences of C2H2-ZFPs are those that combine machine--learning predictions with in vivo binding maps of these proteins. Here, we provide a protocol and guidelines for predicting the DNA-binding preferences of C2H2-ZFPs from their amino acid sequences using a machine learning-based recognition code. This protocol also describes the tools and steps to combine these predictions with ChIP-seq data to remove inaccuracies, identify the zinc-finger domains within each C2H2-ZFP that engage with DNA in vivo, and pinpoint the genomic binding sites of the C2H2-ZFPs.

| İnönü Üniversitesi | Kütüphane | Rehber | OAI-PMH |

Bu site Creative Commons Alıntı-Gayri Ticari-Türetilemez 4.0 Uluslararası Lisansı ile korunmaktadır.


İnönü Üniversitesi, Battalgazi, Malatya, TÜRKİYE
İçerikte herhangi bir hata görürseniz lütfen bize bildirin

DSpace 7.6.1, Powered by İdeal DSpace

DSpace yazılımı telif hakkı © 2002-2025 LYRASIS

  • Çerez Ayarları
  • Gizlilik Politikası
  • Son Kullanıcı Sözleşmesi
  • Geri Bildirim