Molecular diversity of drug resistant mycobacterium tuberculosis strains in western Turkey

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorSürücüoğlu, Süheyla
dc.contributor.authorGünal, Selami
dc.contributor.authorÖzkütük, Nuri
dc.contributor.authorBiçmen, Can
dc.contributor.authorÖzsöz, Ayşe
dc.contributor.authorGazi, Hörü
dc.contributor.authorDurmaz, Rıza
dc.date.accessioned2020-12-06T17:08:37Z
dc.date.available2020-12-06T17:08:37Z
dc.date.issued2012
dc.departmentİnönü Üniversitesien_US
dc.descriptionYıl: 2012Cilt: 29Sayı: 2ISSN: 2146-3123 / 2146-3131Sayfa Aralığı: 160 - 165Metin Dili:İngilizceen_US
dc.description.abstractÖz: Amaç: Bu çalışmanın amacı Türkiye’nin Batısında izole edilen ilaca dirençli Mycobacterium tuberculosis kökenlerinin moleküler çeşitliliğini ve klonal ilişkisini araştırmaktır. Gereç ve Yöntem: 2006-2009 yılları arasında izole edilen sekizi rifampisine tek ilaç dirençli, 79’u çok ilaca dirençli olmak üzere toplam 87 köken IS6110 RFLP ve spoligotiplendirme yöntemleri ile incelenmiştir. Bulgular: Spoligotiplendirme sonuçlarına göre kökenlerin %7’si öksüz olarak tanımlanmış, %8’i ise SpoIDB4 veri tabanına göre tanımlanamayan ailelere ait bulunmuştur. Kökenlerin ait olduğu aileler LAM (%38), T (%35), Harlem (%7), Beijing (%2), S (%2) ve U (%1) olarak belirlenmiştir. Spoligotiplendirme sonuçlarına göre kümelenme oranı %75 olarak hesaplanmıştır. En baskın (%29) SIT kümesi SIT41’dir. IS6110 RFLP sonuçlarına göre 71 farklı IS6110 kalıbı izlenmiştir. Kökenlerin %26’sında kopya sayısı düşük bulunmuştur. Her iki yöntemin sonuçları birlikte değerlendirildiğinde kümelenme oranı %26 olarak bulunmuştur. Sonuçlar: Bölgemizde izole edilen ilaca dirençli tüberküloz basili kökenlerinin genotipik dağılımı çeşitlilik göstermektedir ve bölgemizde kümelenme oranı düşük bulunmuştur. Ancak ilaca dirençli kökenlerin kontrolü için daha kapsamlı ve uzun süren moleküler epidemiyolojik araştırmalara gereksinim vardır.en_US
dc.description.abstractAbstract: Objective: The aim of this study was to investigate the molecular diversity and clonal relationship of drug resistant Mycobacterium tuberculosis strains isolated in Western Turkey. Materials and Methods: A total of 87 strains isolated between 2006 and 2009, eight of which were rifampicin monoresistant and 79 were multidrug resistant, were analyzed with IS6110 RFLP and spoligotyping methods. Results: The results of spoligotyping showed that 7% of the strains were orphans, and 8% were undefined for family in the SpolDB4 database. Major families of the strains were LAM (38%), T (35%), Haarlem (7%), Beijing (2%), S (2%) and U (1%) families. The clustering rate by spoligotyping was calculated as 75%. The most predominant SIT cluster was SIT41 (29%). According to the results of IS6110 RFLP, 71 different patterns of IS6110 were observed. Low copy number was found in 26% of the strains. When the results of two methods were combined, the final clustering rate was calculated as 26%. Conclusions: The genotypical distribution of drug resistant tuberculosis isolates in our region indicates genetic diversity and the clustering rate was found low in our region. However, more comprehensive and long-term molecular epidemiological studies are needed to control the drug resistant strains.en_US
dc.identifier.citationSÜRÜCÜOĞLU S,GÜNAL S,ÖZKÜTÜK N,BİÇMEN C,ÖZSÖZ A,GAZİ H,DURMAZ R (2012). Molecular diversity of drug resistant mycobacterium tuberculosis strains in western Turkey. Balkan Medical Journal, 29(2), 160 - 165.en_US
dc.identifier.endpage165en_US
dc.identifier.issn2146-3123
dc.identifier.issn2146-3131
dc.identifier.issue2en_US
dc.identifier.pmid25206987en_US
dc.identifier.startpage160en_US
dc.identifier.trdizinid143223en_US
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11616/19035
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/yayin/detay/143223
dc.identifier.volume29en_US
dc.identifier.wosWOS:000315504700010en_US
dc.identifier.wosqualityQ4en_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.indekslendigikaynakWeb of Scienceen_US
dc.indekslendigikaynakPubMeden_US
dc.language.isotren_US
dc.publisherBalkan Medical Journalen_US
dc.relation.ispartofBalkan Medical Journalen_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.titleMolecular diversity of drug resistant mycobacterium tuberculosis strains in western Turkeyen_US
dc.title.alternativeTürkiye’nin batısında izole edilen ilaca dirençli mycobacterium tuberculosis kökenlerinin moleküler çeşitliliğien_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Makale Dosyası.pdf
Boyut:
337.94 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Makale Dosyası
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.71 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
PubMed İndeksli Yayın Koleksiyonu
WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu