Cloning and expression of SARS-COV-2 spike gene in bacteria and yeast

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorGeçkı?l, Hı?kmet
dc.contributor.authorÖzşahı?n, Okan
dc.date.accessioned2024-08-11T19:26:16Z
dc.date.available2024-08-11T19:26:16Z
dc.date.issued2023
dc.departmentEnstitüler, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalıen_US
dc.description.abstractŞiddetli Akut Solunum Sendromu Koronavirüs 2 (SARS-CoV-2), 2019 yılında Çin'in Wuhan şehrinde ortaya çıkan, koronavirüs hastalığına (COVID-19) neden olan, zarflı, pozitif anlamlı, tek sarmallı bir RNA virüsüdür. Virüs partikülleri bir RNA (mRNA), yapısal proteinler, yapısal olmayan proteinler (NSP'ler) ve yardımcı proteinler içerir. Virüs, konakçı hücrelerin yüzeyindeki reseptörler aracılığıyla hücreye girdikten sonra 4 yapısal protein; Spike, Membran, Nükleokapsid, Zarf (S, M, N, E), yaklaşık 20 yapısal olmayan protein (NSP'ler) ve bir düzine yardımcı protein (AP'ler) yapılır. Virüsün girişi, partikül oluşması ve bağışıklıktan kaçması için yapısal proteinler gerekliyken, NSP'ler ve AP'ler transkripsiyon, replikasyon ve konak hücre kontrolünde önemlidir. Virüsün en büyük protein olan Spike glikoproteini viral bağlanma ve konakçıya girişe aracılık ettiğinden aşı geliştirme, monoklonal antikor tedavileri ve antijen bazlı veya PCR tanı testleri için önemli bir hedef olmuştur. Bu çalışmada Spike geni hem bakteri hem de mayada replikasyon ve ekspresyon yapabilen bir mekik vektörüne klonlanmış ve proteinin ifade profili araştırılmıştır. Çalışmamız hem bakteri hem de mayanın Spike proteinini ifade ettiğini ve rekombinant mekik vektörünün her iki hücre tipinde de kararlı bir şekilde muhafaza edildiğini gösterdi. Anahtar Kelimeler: SARS-CoV-2, COVID-19, Koronavirüsler, Spike proteini, Mekik vektörler, Escherichia coli, Sacharomyces cerevisiae.en_US
dc.description.abstractSevere Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is an enveloped, positive-sense, single-stranded RNA virus that causes coronavirus disease (COVID-19) that emerged in 2019 in Wuhan city of China. Virus particles contain an RNA (mRNA), structural proteins, non-structural proteins (NSPs), and accessory proteins. After the virus enters the cell via receptors on the surface of host cells, 4 structural proteins; Spike, Membrane, Nucleocapsid, Envelope (S, M, N, E), about 20 non-structural proteins (NSPs), and a dozen accessory proteins (APs) are made. While structural proteins are required for virus entry, assembly, and immune evasion, NSPs and APs are important in transcription, replication, and host cell control. Since the Spike glycoprotein, the largest protein of the virus, mediates viral attachment and entry into the host, it has been an important target for vaccine development, monoclonal antibody therapies, and antigen-based or PCR diagnostic tests. In this study, the Spike gene was cloned into a shuttle vector that can replicate and express in both bacteria and yeast, and the expression profile of the protein was investigated. Our study showed that both bacteria and yeast expressed the Spike protein and the recombinant shuttle vector was stably maintained in both cell types. Keywords: SARS-CoV-2, COVID-19, Coronaviruses, Spike protein, Shuttle vectors, Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae.en_US
dc.identifier.endpage66en_US
dc.identifier.startpage1en_US
dc.identifier.urihttps://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=weFMBHaUra8rsS5wi2bmHEGs8xb6uOOr3ig8CFrgDa4_Bt41b5iwUSQwO7JDda7r
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11616/105091
dc.identifier.yoktezid840850en_US
dc.language.isoenen_US
dc.publisherİnönü Üniversitesien_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectBiyomühendisliken_US
dc.subjectBioengineeringen_US
dc.subjectMikrobiyolojien_US
dc.titleCloning and expression of SARS-COV-2 spike gene in bacteria and yeasten_US
dc.title.alternativeBakteri ve mayalarda SARS-COV-2 spıke geninin klonlanması ve ifade edilmesien_US
dc.typeMaster Thesisen_US

Dosyalar

Koleksiyon

Fen Bilimleri Enstitüsü Tez Koleksiyonu