WSSPAS: An Interactive Web Application for Sample Size and Power Analysis with R Using Shiny
Küçük Resim Yok
Dosyalar
Tarih
2018
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Abstract: Objective: The calculation of sample size and power analysis plays an important role in biomedical research. The most general definition of the calculation of the sample size and power analysis is to determine the minimum number of individuals that have the ability to represent the population during the planning phase of the study. Since the statistical methods for each research plan are different, the calculation of sample size and power analysis will be different. Therefore, it is difficult to calculate the sample size and power analysis manually for each clinical trial. The aim of this research is to develop a new user-friendly web-based tool that calculates sample size and power analysis for hypothesis testing, diagnostic tests, correlation and regression analysis using the open source software R Shiny package and guides the researchers with examples. Material and Method: This web tool will be updated upon the updated R software packages, including shiny, shinydashboard, pwr, powerAnalysis, powerMediation, MKmisc and rhandsontable. Scripts were written for calculations that could not be done by these packages. Results: Hypothetical samples were created to introduce menus in the web-based software developed for the calculation of sample size and power analysis, and screen images of the results of these samples were given. Conclusion: The designed interactive web application is freely accessible through http: //biostatapps.inonu.edu.tr/WSSPAS. In the future studies, it is aimed to further strengthen the software by adding modules that can calculate sample size and power analysis for different multivariate statistical and machine learning methods.
Öz: Amaç: Biyomedikal araştırmalarda örneklem büyüklüğü ve güç analizinin hesaplanması önemli bir rol oynamaktadır. Örneklem büyüklüğünün ve güç analizinin hesaplanmasının en genel tanımı, çalışmanın planlama aşaması sırasında popülasyonu temsil etme kapasitesine sahip olan asgari kişi sayısını belirlemektir. Her bir araştırma planı için istatistiksel yöntemler farklı olduğundan, örneklem büyüklüğü ve güç analizinin hesaplanması farklı olacaktır. Bu nedenle, her klinik deneme için örneklem büyüklüğü ve güç analizini manuel olarak hesaplamak zordur. Bu araştırmanın amacı, açık kaynak kodlu yazılım R Shiny paketini kullanarak hipotez testi, tanı testleri, korelasyon ve regresyon analizi için örneklem büyüklüğü ve güç analizini hesaplayan ve araştırmacılara örneklerle rehberlik eden yeni bir kullanıcı dostu web tabanlı araç geliştirmektir. Gereç ve Yöntemler: Bu web tabanlı yazılım, shiny, shinydashboard, pwr, powerAnalysis, powerMediation, MKmisc, WebPower and rhandsontable dahil olmak üzere güncellenmiş R yazılım paketleri üzerine geliştirilmiştir. Bu paketler tarafından yapılamayan hesaplamalar için komut dosyaları manuel olarak yazılmıştır. Bulgular: Örneklem büyüklüğü ve güç analizinin hesaplanması için geliştirilen web tabanlı yazılımda menüler tanıtmak için hipotetik örnekler oluşturulmuş ve bu örneklerin sonuçlarının ekran görüntüleri verilmiştir. Sonuç: Tasarlanan interaktif web uygulamasına http: //biostatapps.inonu.edu.tr/WSSPAS aracılığıyla kolayca erişilebilir. Ayrıca ilerleyen çalışmalarda farklı çok değişkenli istatistiksel ve makine öğrenmesi yöntemleri için de örneklem büyüklüğü ve güç analizini hesaplayabilen modüllerin eklenmesiyle, yazılımın daha da güçlendirilmesi hedeflenmektedir.
Öz: Amaç: Biyomedikal araştırmalarda örneklem büyüklüğü ve güç analizinin hesaplanması önemli bir rol oynamaktadır. Örneklem büyüklüğünün ve güç analizinin hesaplanmasının en genel tanımı, çalışmanın planlama aşaması sırasında popülasyonu temsil etme kapasitesine sahip olan asgari kişi sayısını belirlemektir. Her bir araştırma planı için istatistiksel yöntemler farklı olduğundan, örneklem büyüklüğü ve güç analizinin hesaplanması farklı olacaktır. Bu nedenle, her klinik deneme için örneklem büyüklüğü ve güç analizini manuel olarak hesaplamak zordur. Bu araştırmanın amacı, açık kaynak kodlu yazılım R Shiny paketini kullanarak hipotez testi, tanı testleri, korelasyon ve regresyon analizi için örneklem büyüklüğü ve güç analizini hesaplayan ve araştırmacılara örneklerle rehberlik eden yeni bir kullanıcı dostu web tabanlı araç geliştirmektir. Gereç ve Yöntemler: Bu web tabanlı yazılım, shiny, shinydashboard, pwr, powerAnalysis, powerMediation, MKmisc, WebPower and rhandsontable dahil olmak üzere güncellenmiş R yazılım paketleri üzerine geliştirilmiştir. Bu paketler tarafından yapılamayan hesaplamalar için komut dosyaları manuel olarak yazılmıştır. Bulgular: Örneklem büyüklüğü ve güç analizinin hesaplanması için geliştirilen web tabanlı yazılımda menüler tanıtmak için hipotetik örnekler oluşturulmuş ve bu örneklerin sonuçlarının ekran görüntüleri verilmiştir. Sonuç: Tasarlanan interaktif web uygulamasına http: //biostatapps.inonu.edu.tr/WSSPAS aracılığıyla kolayca erişilebilir. Ayrıca ilerleyen çalışmalarda farklı çok değişkenli istatistiksel ve makine öğrenmesi yöntemleri için de örneklem büyüklüğü ve güç analizini hesaplayabilen modüllerin eklenmesiyle, yazılımın daha da güçlendirilmesi hedeflenmektedir.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Kaynak
Türkiye Klinikleri Biyoistatistik Dergisi
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
10
Sayı
3
Künye
ARSLAN A. K,YAŞAR Ş,ÇOLAK C,YOLOĞLU S (2018). WSSPAS: An Interactive Web Application for Sample Size and Power Analysis with R Using Shiny. Türkiye Klinikleri Biyoistatistik Dergisi, 10(3), 224 - 246. Doi: 10.5336/biostatic.2018-62787